در این دنباله پر اکشن برای راهاندازی مجدد 2014، لاکپشتهای نینجا جهش یافته نوجوان با بزرگترین چالش خود روبرو میشوند، زمانی که شردر از بازداشت فرار میکند و با شخصیت منفی کرانگ متحد میشود. با کمک آوریل اونیل و کیسی جونز، لاک پشت ها باید از تهاجم بیگانگان جلوگیری کنند و در عین حال با تهدیدات تازه جهش یافته Bebop و Rocksteady مقابله کنند.